วันอังคารที่ 8 กรกฎาคม 2014.- ทีมนักวิจัยจาก Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR) ได้เข้าร่วมในการสอบสวนระดับนานาชาติซึ่งระบุว่ามีแบคทีเรียจุลินทรีย์ใหม่ 518 ตัวที่ยังไม่เคยมีมาก่อนในจุลินทรีย์มนุษย์ (ลำไส้พืช)
การวิจัยซึ่งนักวิทยาศาสตร์ได้ใช้วิธีการใหม่ในการวิเคราะห์ข้อมูลทางชีวภาพยังได้ขยายแคตตาล็อกของยีนจุลินทรีย์ที่รู้จักจาก 3 ถึง 10 ล้าน
ผลการวิจัยนี้ตีพิมพ์เมื่อวันอาทิตย์โดยวารสาร Nature Biotechnology เป็นส่วนหนึ่งของโครงการ MetaHIT ของยุโรป (ระบบทางเดินอาหารของมนุษย์ Metagenomics) ได้รับเงิน 11.4 ล้านยูโรเพื่อตรวจสอบว่าจุลชีพของมนุษย์เกี่ยวข้องกับสุขภาพและโรคอย่างไร . Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR) เป็นหนึ่งใน 13 คนที่เข้าร่วมในโครงการนี้ - และเป็นศูนย์กลางแห่งสเปนเพียงแห่งเดียว - ภายใต้การดูแลของดร. ฟรานซิสโกกวาร์เนอร์ผู้อธิบายว่า จำนวนชนิดที่ไม่รู้จัก
ตัวอย่างของลำไส้ของบุคคลบางชนิดมีน้อยมากและเมื่อวิเคราะห์ในรายละเอียดได้เห็นว่าพวกเขาเป็นตัวอย่างของผู้ป่วยโรค Crohn "สิ่งนี้ชี้ให้เห็นว่าสปีชีส์เหล่านี้ซึ่งไม่ทราบมาก่อนนี้อาจเป็นสัตว์ที่สร้างความแตกต่างระหว่างจุลชีวะของคนที่มีสุขภาพดีและคนที่ป่วย" Guarner ประกาศ
นักวิจัยเปิดเผยว่าข้อมูลเหล่านี้เป็นกลยุทธ์ที่เปิดใช้เพื่อพยายามกู้คืนสปีชีส์เหล่านี้ด้วยวิธีการทางโภชนาการ: การจัดการเส้นใยพรีไบโอติกที่ช่วยในการเจริญเติบโตของบางสายพันธุ์หรือโปรไบโอติก
แบคทีเรียที่ไม่รู้จักเหล่านี้น่าจะเรียกกันว่า "แบคทีเรียที่ดี" เพราะไม่ใช่แบคทีเรียทั่วไปที่ก่อให้เกิดการติดเชื้อและไม่เป็นที่รู้จักหรือโดดเดี่ยวมาก่อน ตาม Guarner แบคทีเรียที่ค้นพบไม่สามารถแยกได้เพราะ "เกือบจะแน่นอนว่าพวกมันจะไม่รอดจากภายนอกลำไส้ใหญ่เพื่อที่จะทำการปลูกถ่าย"
บุคคลที่รับผิดชอบงานและนักวิจัยของกลุ่มสรีรวิทยาและพยาธิสรีรวิทยาของ VHIR ได้ชี้ให้เห็นว่าสายพันธุ์ใหม่ที่ค้นพบ "ไม่สามารถเพาะปลูกได้มีความไวต่อออกซิเจนมากนั่นคือพวกมันมีความเข้มงวดมากและสร้างสภาพแวดล้อมที่น่าเชื่อถือ เอาตัวรอด " “ ด้วยเหตุผลเดียวกันเมื่อเราไปที่ฐานข้อมูลเราไม่พบร่องรอยและจนถึงตอนนี้เราไม่รู้อะไรเลยเกี่ยวกับพวกเขา” Guarner กล่าว
การค้นพบครั้งนี้เป็นไปได้ด้วยวิธีการใหม่ในการวิเคราะห์ทางชีวภาพที่ทำให้สายพันธุ์เหล่านี้ "พื้นผิว"
"ปัจจุบัน - อ้างอิงจาก Guarner - มีเพียง 10% ของสารพันธุกรรมที่เป็นลำดับเท่านั้นที่ทราบกันดีว่ามีความน่าเชื่อถือ 95% สิ่งนี้ทำให้พื้นที่สีเทาขนาดใหญ่ที่กำลังทำงานอยู่ในตอนนี้"
การศึกษาได้ตรวจพบสายพันธุ์ metagenomic 741 สายพันธุ์ที่แตกต่างกันชื่อสำหรับความเป็นไปไม่ได้ของการกำหนดชื่อให้พวกเขา เมื่อเปรียบเทียบกับฐานข้อมูลนักวิจัยได้เห็นว่า 115 ชนิดนี้เป็นที่รู้จักกันแล้วในขณะที่ 518 ไม่เป็นที่รู้จัก; ที่เหลืออีก 108 คนเป็นที่รู้จักกันในบางส่วน
“ ตอนนี้เรารู้แล้วว่าจีโนมของเผ่าพันธุ์ metagenomic เหล่านี้มีลักษณะอย่างไร แต่ไม่ใช่ชื่อและนามสกุลของพวกมัน” Guarner อธิบาย
มีจำนวนน้อยที่ไม่ทราบชนิด แต่เพศหรือครอบครัวที่เป็นสมาชิกและประมาณ 200 สายพันธุ์ metagenomic ของสิ่งที่อธิบายไม่สามารถจำแนกได้ในทางใดทางหนึ่งเพราะกว่า 80% ของยีนของพวกเขาไม่รู้ ในวันนี้
ตามที่นักวิทยาศาสตร์กล่าวว่าจุลินทรีย์ที่มีชีวิตอยู่ในมนุษย์นั้นมีอยู่ประมาณ 100 พันล้านเท่ามากกว่าเซลล์มนุษย์ทั้งหมดถึง 10 เท่า
ผลเริ่มต้นของโครงการเดียวกันนี้ในปี 2010 ชี้ไปที่ 3, 300, 000 ยีนที่แตกต่างกันแปลเป็น 20, 000 ฟังก์ชั่นที่แตกต่างกัน 5, 000 ซึ่งยังไม่ทราบโดยสิ้นเชิง
แต่ละคนมียีนจุลินทรีย์เหล่านี้ประมาณ 600, 000 คนและซ้ำอีก 300, 000 คนอย่างต่อเนื่องในหมู่ทุกคน “ ในการศึกษาใหม่นี้จะมีการเพิ่มจำนวนถึงสามและ 9, 879, 896 ยีนที่แตกต่างกัน” Guarner กล่าว
ที่มา:
แท็ก:
สุขภาพ ความงาม ต่าง
การวิจัยซึ่งนักวิทยาศาสตร์ได้ใช้วิธีการใหม่ในการวิเคราะห์ข้อมูลทางชีวภาพยังได้ขยายแคตตาล็อกของยีนจุลินทรีย์ที่รู้จักจาก 3 ถึง 10 ล้าน
ผลการวิจัยนี้ตีพิมพ์เมื่อวันอาทิตย์โดยวารสาร Nature Biotechnology เป็นส่วนหนึ่งของโครงการ MetaHIT ของยุโรป (ระบบทางเดินอาหารของมนุษย์ Metagenomics) ได้รับเงิน 11.4 ล้านยูโรเพื่อตรวจสอบว่าจุลชีพของมนุษย์เกี่ยวข้องกับสุขภาพและโรคอย่างไร . Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR) เป็นหนึ่งใน 13 คนที่เข้าร่วมในโครงการนี้ - และเป็นศูนย์กลางแห่งสเปนเพียงแห่งเดียว - ภายใต้การดูแลของดร. ฟรานซิสโกกวาร์เนอร์ผู้อธิบายว่า จำนวนชนิดที่ไม่รู้จัก
ตัวอย่างของลำไส้ของบุคคลบางชนิดมีน้อยมากและเมื่อวิเคราะห์ในรายละเอียดได้เห็นว่าพวกเขาเป็นตัวอย่างของผู้ป่วยโรค Crohn "สิ่งนี้ชี้ให้เห็นว่าสปีชีส์เหล่านี้ซึ่งไม่ทราบมาก่อนนี้อาจเป็นสัตว์ที่สร้างความแตกต่างระหว่างจุลชีวะของคนที่มีสุขภาพดีและคนที่ป่วย" Guarner ประกาศ
"แบคทีเรียที่ดี"
นักวิจัยเปิดเผยว่าข้อมูลเหล่านี้เป็นกลยุทธ์ที่เปิดใช้เพื่อพยายามกู้คืนสปีชีส์เหล่านี้ด้วยวิธีการทางโภชนาการ: การจัดการเส้นใยพรีไบโอติกที่ช่วยในการเจริญเติบโตของบางสายพันธุ์หรือโปรไบโอติก
แบคทีเรียที่ไม่รู้จักเหล่านี้น่าจะเรียกกันว่า "แบคทีเรียที่ดี" เพราะไม่ใช่แบคทีเรียทั่วไปที่ก่อให้เกิดการติดเชื้อและไม่เป็นที่รู้จักหรือโดดเดี่ยวมาก่อน ตาม Guarner แบคทีเรียที่ค้นพบไม่สามารถแยกได้เพราะ "เกือบจะแน่นอนว่าพวกมันจะไม่รอดจากภายนอกลำไส้ใหญ่เพื่อที่จะทำการปลูกถ่าย"
บุคคลที่รับผิดชอบงานและนักวิจัยของกลุ่มสรีรวิทยาและพยาธิสรีรวิทยาของ VHIR ได้ชี้ให้เห็นว่าสายพันธุ์ใหม่ที่ค้นพบ "ไม่สามารถเพาะปลูกได้มีความไวต่อออกซิเจนมากนั่นคือพวกมันมีความเข้มงวดมากและสร้างสภาพแวดล้อมที่น่าเชื่อถือ เอาตัวรอด " “ ด้วยเหตุผลเดียวกันเมื่อเราไปที่ฐานข้อมูลเราไม่พบร่องรอยและจนถึงตอนนี้เราไม่รู้อะไรเลยเกี่ยวกับพวกเขา” Guarner กล่าว
สายพันธุ์ metagenomic ที่แตกต่างกัน
การค้นพบครั้งนี้เป็นไปได้ด้วยวิธีการใหม่ในการวิเคราะห์ทางชีวภาพที่ทำให้สายพันธุ์เหล่านี้ "พื้นผิว"
"ปัจจุบัน - อ้างอิงจาก Guarner - มีเพียง 10% ของสารพันธุกรรมที่เป็นลำดับเท่านั้นที่ทราบกันดีว่ามีความน่าเชื่อถือ 95% สิ่งนี้ทำให้พื้นที่สีเทาขนาดใหญ่ที่กำลังทำงานอยู่ในตอนนี้"
การศึกษาได้ตรวจพบสายพันธุ์ metagenomic 741 สายพันธุ์ที่แตกต่างกันชื่อสำหรับความเป็นไปไม่ได้ของการกำหนดชื่อให้พวกเขา เมื่อเปรียบเทียบกับฐานข้อมูลนักวิจัยได้เห็นว่า 115 ชนิดนี้เป็นที่รู้จักกันแล้วในขณะที่ 518 ไม่เป็นที่รู้จัก; ที่เหลืออีก 108 คนเป็นที่รู้จักกันในบางส่วน
“ ตอนนี้เรารู้แล้วว่าจีโนมของเผ่าพันธุ์ metagenomic เหล่านี้มีลักษณะอย่างไร แต่ไม่ใช่ชื่อและนามสกุลของพวกมัน” Guarner อธิบาย
มีจำนวนน้อยที่ไม่ทราบชนิด แต่เพศหรือครอบครัวที่เป็นสมาชิกและประมาณ 200 สายพันธุ์ metagenomic ของสิ่งที่อธิบายไม่สามารถจำแนกได้ในทางใดทางหนึ่งเพราะกว่า 80% ของยีนของพวกเขาไม่รู้ ในวันนี้
คนมียีนจุลินทรีย์ 600, 000
ตามที่นักวิทยาศาสตร์กล่าวว่าจุลินทรีย์ที่มีชีวิตอยู่ในมนุษย์นั้นมีอยู่ประมาณ 100 พันล้านเท่ามากกว่าเซลล์มนุษย์ทั้งหมดถึง 10 เท่า
ผลเริ่มต้นของโครงการเดียวกันนี้ในปี 2010 ชี้ไปที่ 3, 300, 000 ยีนที่แตกต่างกันแปลเป็น 20, 000 ฟังก์ชั่นที่แตกต่างกัน 5, 000 ซึ่งยังไม่ทราบโดยสิ้นเชิง
แต่ละคนมียีนจุลินทรีย์เหล่านี้ประมาณ 600, 000 คนและซ้ำอีก 300, 000 คนอย่างต่อเนื่องในหมู่ทุกคน “ ในการศึกษาใหม่นี้จะมีการเพิ่มจำนวนถึงสามและ 9, 879, 896 ยีนที่แตกต่างกัน” Guarner กล่าว
ที่มา:
