วันจันทร์ที่ 24 มิถุนายน 2013 นักวิทยาศาสตร์จากออสเตรเลียและสหรัฐอเมริกาให้ความรู้ใหม่เกี่ยวกับการทำความเข้าใจโครงสร้างสามมิติของจีโนมซึ่งเป็นหนึ่งในความท้าทายที่ยิ่งใหญ่ที่สุดที่กำลังเผชิญอยู่ในสาขาจีโนมิกส์และพันธุศาสตร์ พันธุศาสตร์ธรรมชาติ
ดีเอ็นเอประมาณสามเมตรนั้นถูกพับไว้อย่างใกล้ชิดในนิวเคลียสของแต่ละเซลล์ในร่างกายของเราซึ่งทำให้ยีนบางตัวสามารถ "แสดง" หรือเปิดใช้งานได้โดยไม่รวมตัวอื่น ๆ แพทย์ Tim Mercer และ John Mattick จากสถาบันวิจัยทางการแพทย์ Garvan ในซิดนีย์และศาสตราจารย์ John Stamatoyannopoulos แห่งมหาวิทยาลัย Washington ใน Seattle ได้ทำการวิเคราะห์โครงสร้าง 3 มิติของจีโนมด้วยความละเอียดสูง
ยีนประกอบด้วย "exons" และ "introns" ลำดับแรกคือลำดับที่เข้ารหัสและแสดงโปรตีนและสุดท้ายเป็นการยืดของ DNA ที่ไม่เข้ารหัสในสื่อ เมื่อยีนถูกคัดลอกหรือถอดความจาก DNA ใน RNA ลำดับ intron จะถูกตัดหรือ "spliced" และ exons ที่เหลือจะถูกล่ามโซ่ไว้ด้วยกันเพื่อสร้างลำดับการเข้ารหัสโปรตีน ยีนเดียวกันสามารถสร้างโปรตีนที่แตกต่างกันขึ้นอยู่กับ exons ที่ถูกเบ้
ด้วยการใช้ข้อมูลจำนวนมากจากโครงการ ENCODE ดร. ทิมเมอร์เซอร์และเพื่อนร่วมงานของเขาได้สรุปการพับของจีโนมค้นพบว่าแม้ในยีนยีน exons ที่เลือกจะถูกเปิดเผยได้อย่างง่ายดาย “ ลองนึกภาพเถาวัลย์ที่ซับซ้อนและยาวเหยียดกิ่งก้านบิดที่นำเสนอองุ่นบางอันที่สามารถฉีกออกได้ง่ายในขณะที่ซ่อนผู้อื่นไว้ไม่ให้ไกลเกินเอื้อม” เขาเป็นตัวอย่าง เมอร์เซอร์
"ในเวลาเดียวกันลองนึกภาพคนเก็บผลไม้ขี้เกียจแค่หยิบองุ่นมาที่ปลายนิ้วของคุณ - เขาเสริม - หลักการเดียวกันนี้ใช้กับจีโนมยีนที่เฉพาะเจาะจงและแม้แต่ exons ที่เฉพาะเจาะจงนั้นอยู่ใกล้แค่พับ" ในแง่นี้นักวิจัยชี้ให้เห็นว่าในช่วงไม่กี่ปีที่ผ่านมานักวิทยาศาสตร์ได้เริ่มชื่นชมว่าการพับจีโนมช่วยตัดสินว่ามันแสดงออกและควบคุมอย่างไร
การศึกษาครั้งนี้แสดงข้อบ่งชี้แรกว่าโครงสร้างสามมิติของจีโนมสามารถมีอิทธิพลต่อการประกบของยีนเราสามารถอนุมานได้ว่าจีโนมพับในลักษณะที่ภูมิภาคโปรโมเตอร์ลำดับที่เริ่มการถอดรหัสของยีนคือ พบถัดจาก exons และพวกเขาทั้งหมดถูกนำไปที่เครื่องจักรการถอดความ "เขาเน้น
สิ่งนี้สนับสนุนวิธีการใหม่ในการมองสิ่งต่าง ๆ ซึ่งจีโนมจะโค้งไปรอบ ๆ กลไกการถอดความแทนที่จะเป็นอีกทางหนึ่งยีนเหล่านั้นที่สัมผัสกับเครื่องจักรการถอดความได้รับสำเนาในขณะที่ชิ้นส่วนที่โคจรอยู่ห่างไกล พวกเขาจะถูกละเว้น "สรุปนักวิจัยนี้
ที่มา:
แท็ก:
เพศ ครอบครัว สุขภาพ
ดีเอ็นเอประมาณสามเมตรนั้นถูกพับไว้อย่างใกล้ชิดในนิวเคลียสของแต่ละเซลล์ในร่างกายของเราซึ่งทำให้ยีนบางตัวสามารถ "แสดง" หรือเปิดใช้งานได้โดยไม่รวมตัวอื่น ๆ แพทย์ Tim Mercer และ John Mattick จากสถาบันวิจัยทางการแพทย์ Garvan ในซิดนีย์และศาสตราจารย์ John Stamatoyannopoulos แห่งมหาวิทยาลัย Washington ใน Seattle ได้ทำการวิเคราะห์โครงสร้าง 3 มิติของจีโนมด้วยความละเอียดสูง
ยีนประกอบด้วย "exons" และ "introns" ลำดับแรกคือลำดับที่เข้ารหัสและแสดงโปรตีนและสุดท้ายเป็นการยืดของ DNA ที่ไม่เข้ารหัสในสื่อ เมื่อยีนถูกคัดลอกหรือถอดความจาก DNA ใน RNA ลำดับ intron จะถูกตัดหรือ "spliced" และ exons ที่เหลือจะถูกล่ามโซ่ไว้ด้วยกันเพื่อสร้างลำดับการเข้ารหัสโปรตีน ยีนเดียวกันสามารถสร้างโปรตีนที่แตกต่างกันขึ้นอยู่กับ exons ที่ถูกเบ้
ด้วยการใช้ข้อมูลจำนวนมากจากโครงการ ENCODE ดร. ทิมเมอร์เซอร์และเพื่อนร่วมงานของเขาได้สรุปการพับของจีโนมค้นพบว่าแม้ในยีนยีน exons ที่เลือกจะถูกเปิดเผยได้อย่างง่ายดาย “ ลองนึกภาพเถาวัลย์ที่ซับซ้อนและยาวเหยียดกิ่งก้านบิดที่นำเสนอองุ่นบางอันที่สามารถฉีกออกได้ง่ายในขณะที่ซ่อนผู้อื่นไว้ไม่ให้ไกลเกินเอื้อม” เขาเป็นตัวอย่าง เมอร์เซอร์
"ในเวลาเดียวกันลองนึกภาพคนเก็บผลไม้ขี้เกียจแค่หยิบองุ่นมาที่ปลายนิ้วของคุณ - เขาเสริม - หลักการเดียวกันนี้ใช้กับจีโนมยีนที่เฉพาะเจาะจงและแม้แต่ exons ที่เฉพาะเจาะจงนั้นอยู่ใกล้แค่พับ" ในแง่นี้นักวิจัยชี้ให้เห็นว่าในช่วงไม่กี่ปีที่ผ่านมานักวิทยาศาสตร์ได้เริ่มชื่นชมว่าการพับจีโนมช่วยตัดสินว่ามันแสดงออกและควบคุมอย่างไร
การศึกษาครั้งนี้แสดงข้อบ่งชี้แรกว่าโครงสร้างสามมิติของจีโนมสามารถมีอิทธิพลต่อการประกบของยีนเราสามารถอนุมานได้ว่าจีโนมพับในลักษณะที่ภูมิภาคโปรโมเตอร์ลำดับที่เริ่มการถอดรหัสของยีนคือ พบถัดจาก exons และพวกเขาทั้งหมดถูกนำไปที่เครื่องจักรการถอดความ "เขาเน้น
สิ่งนี้สนับสนุนวิธีการใหม่ในการมองสิ่งต่าง ๆ ซึ่งจีโนมจะโค้งไปรอบ ๆ กลไกการถอดความแทนที่จะเป็นอีกทางหนึ่งยีนเหล่านั้นที่สัมผัสกับเครื่องจักรการถอดความได้รับสำเนาในขณะที่ชิ้นส่วนที่โคจรอยู่ห่างไกล พวกเขาจะถูกละเว้น "สรุปนักวิจัยนี้
ที่มา:
